万太郎（神木隆之介）、寿恵子（浜辺美波）、千歳（遠藤さくら）、千鶴（本田望結）、虎鉄（濱田龍臣）たち家族みんなは無事だったが、長屋の標本や原稿は…

大正１２年９月１日、関東大震災が発生。長屋は倒壊し、万太郎（神木隆之介）、寿恵子（浜辺美波）、千歳（遠藤さくら）千鶴（本田望結）たちは渋谷へと向かう。

万太郎（神木隆之介）は徳永（田中哲司）に辞表を提出。大学を去る日、佑一郎（中村蒼）がやってくる。時代は大正へ。千歳（遠藤さくら）と虎鉄（濱田龍臣）は結婚する。

万太郎（神木隆之介）は、大学を辞め一植物学者として生きることを決意。りん（安藤玉恵）は千歳（遠藤さくら）にあるお願いをする。