初回放送日：2004年12月26日
新選組としてまとまった勇（香取慎吾）たちだが、隊規をまとめていくうち、少しずつほころび始める。山南（堺雅人）の切腹から続く隊士の粛清。そんな中、坂本龍馬（江口洋介）の手によって、薩長が手を結び、倒幕へのスピードが加速する。その龍馬も暗殺され、新政府軍と幕府の戦争が始まり、賊軍となった新選組。甲府へ行ってくれと勝海舟（野田秀樹）に頼まれた勇は新政府軍に捕らえられ、歳三（山本耕史）は北へ向かう。