京都の蔵に眠る文化財を全部出し調査。知られざる歴史を発掘する京都千年蔵。第２回の舞台は江戸時代の「オタクの楽園」と言われた学び舎。７５１２点の文化財を徹底調査。膨大な量の生物標本。カラクリ蔵の天井に記された謎のメッセージ。オタク学者の銃や刀ではなく「知」を武器にした戦いに最新科学が挑む。西郷＆岩倉！！維新の英雄たちを惹きつけたオタク結社とは？発掘！！江戸時代版Ｗｉｋｉｐｅｄｉａ＆元祖！！万国博覧会